Есть несколько вариантов.
Самый простой (и наверное неправильный) - запустить find от супер-пользователя:
sudo find / -name "myfile"
Но правильнее будет просто отфильтровать сообщения. Такая конструкция так же отфильтрует и сообщения об ошибках:
find / -name "myfile" 2>/dev/null
Либо еще можно так:
find / -name "myfile" 2>&1 | grep -v 'Permission denied'